紅油豆瓣醬的底料是大豆，其發酵時間一般只有3～6個月，比較適合作為拌料來使用。而郫縣豆瓣醬底料是用二荊條辣椒制作的，其發酵時間可以達到4年，通常會被用來制作成川菜，或者是用于制作火鍋底料、香辣醬。

紅油豆瓣醬是采用新鮮大豆為底料制作而成的，其顏色相對較紅潤。而正宗的郫縣豆瓣醬是采用二荊條辣椒作為底料，同時混入蠶豆、小麥粉發酵而成的。

紅油豆瓣醬發酵的時間一般只有3～6個月，它對原料的利用和提煉僅僅停留在初期，而好的郫縣豆瓣醬往往需要經過4年的發酵時間。

從紅油豆瓣醬和郫縣豆瓣醬的使用方法來看，郫縣豆瓣醬多用于制備川菜、火鍋底料、香辣醬，而紅油豆瓣醬更適合作為普通的拌料，平時吃飯或吃面時可以使用。